Kluyveromyces marxianus, prominent potential yeast in the future

Kluyveromyces marxianus is a budding yeast that has a prominent potential for production of bioethanol, hydrolytic enzymes, food biomass, and food additives (Limtong et al. 2007; Fonseca et al. 2008; Gethins et al. 2014). This yeast can also produce volatile compounds and flavor metabolites (Gethins et al. 2014), enzymes such as β-galactosidase (Fonseca et al. 2008; Zhou et al. 2013), β-glucosidase and polygalacturonase (Fonseca et al. 2008), and inulinase (Fonseca et al. 2008; Kango and Jain 2011; Lertwattanasakul et al. 2011; Zhou et al. 2014) in addition to ethanol from various primary biomasses (Limtong et al. 2007; Fonseca et al. 2008; Goshima et al. 2013) including cellulosic biomass (Matsuzaki et al. 2012; Goshima et al. 2013). K. marxianus DMKU3-1042, which was isolated in Thailand, is one of the most thermotolerant yeast strains that can efficiently produce ethanol at a high temperature (Limtong et al. 2007) and can utilize various sugars such as glucose, galactose, sucrose, arabinose, and xylose (Rodrussamee et al. 2011; Lertwattanasakul et al. 2013; Lertwattanasakul et al. 2015). However, like other microbes, K. marxianus has an intrinsic system of glucose repression, which prevents utilization of other sugars.

Unlike S. cerevisiae, which exhibits a strong glucose repression on sucrose utilization, K. marxianus DMKU3-1042 utilizes sucrose resistantly to glucose repression (Lertwattanasakul et al. 2011). In S. cerevisiae, Mig1 and Hxk2 play key roles as a regulator complex in glucose repression (Ahuatzi et al. 2004), and Mig1 represses the expression of several genes, including GAL83, SUC2, MAL62, LAC4, and LAC12, when glucose is present (Gancedo and Gancedo 1986; Nehlin and Ronne 1990; Sun et al. 2012; Lin et al. 2014; Zou et al. 2015). K. marxianus with MIG1 mutation exhibited increased inulinase production (Zhou et al. 2014) and increased lactose hydrolysis (Zhou et al. 2013). The hexokinase protein Hxk2 in S. cerevisiae, which is an ortholog of Rag5 in K. lactis (Prior et al. 1993) and K. marxianus, is a hexokinase in the glycolytic pathway and also a transcriptional regulator as a complex with Mig1 and other proteins (Ahuatzi et al. 2004; Ahuatzi et al. 2007). Hxk2 is thus a bi-functional protein that is localized in both the cytoplasm and the nucleus (Pelaez et al. 2010; Bergdahl et al. 2013). Recently, Zhang et al. (2017) reported that HXK1-disrupted mutant in K. marxianus exhibited enhancements of inulin hydrolysis and fructose production.

The intracellular location of Hxk2 in S. cerevisiae is changed by the concentration of glucose available. In the presence of a high concentration of glucose, Hxk2 in the cytoplasm moves to the nucleus and forms a complex with dephosphorylated Mig1 and a general co-repressor complex of Cyc8-Tup1 (Ahuatzi et al. 2004). This complex then binds to the upstream regions of promoters of glucose-repressible genes including respiratory and gluconeogenic genes. However, in the presence of a low concentration or absence of glucose, Hxk2 and Mig1 remain in the cytoplasm, where neither Mig1 nor Hxk2 can repress Mig1- regulated genes (Ahuatzi et al. 2004).

Functional analysis of regulators involved in glucose repression in S. cerevisiae has been extensively performed, but the corresponding regulators of K. marxianus have not been investigated well. In particular, no comparison between MIG1 null mutant and RAG5 null mutant has been reported. In this study, to elucidate the roles of MIG1 and RAG5 in glucose repression in K. marxianus, we constructed disrupted mutants of both genes and compared their effects on growth or sugar metabolism with those of disrupted mutants of the corresponding genes, MIG1 and HXK2, respectively, in S. cerevisiae. The first extensive study on the two regulators in K. marxianus suggests that the negative regulation by Mig1 and Rag5 is shared with that by Mig1 and Hxk2 in S. cerevisiae. Positive regulation by Mig1 and Rag5 was discovered, the corresponding one of which has not been reported in S. cerevisiae. Our results also suggest that Mig1 is essential, probably as a positive regulator, for the His biosynthesis pathway in K. marxianus.

 

Buku kesehatan ibu dan anak sebagai bentuk kepedulian dan totalitas masyarakat Jepang terhadap kesehatan

Sebagai mahasiswa asing yang berada di negeri sakura, kemampuan bahasa Jepang sangatlah diperlukan terlebih yang berkaitan dengan urusan akademik. Secara sebagian besar kuliah maupun aktivitas penelitian di laboratorium masih dominan menggunakan bahasa Jepang. Syukur alhamdulilah, di laboratorium tempat aku melakukan eksperimen, semua sensei (sebutan guru dalam bahasa Jepang), senpai (senior/kakak tingkat), kohai (junior/adik tingkat) maupun teman-teman asing dari negara lain dapat berkomunikasi bahasa inggris. Selain itu urusan non akademik seperti belanja di supermarket maupun mall, administrasi kependudukan, asuransi, jasa pengiriman barang, pembayaran tagihan listrik, air, gas, pulsa, internet maupun urusan kesehatan juga memerlukan kemampuan berbahasa Jepang. Lagi-lagi alhamdulilah karena sebagian masyarakat Jepang juga bisa berkomunikasi dalam bahasa inggris dan tersedia juga interpreter atau penerjemah bahasa Jepang ke bahasa Inggris. Betapa repotnya saya dan mungkin anda semua yang kemampuan bahasa Jepangnya terbatas atau bahkan nihil, tetapi tetap harus melakukan semua aktivitas di negeri samurai ini.

Minggu lalu, saya dan istri yang merupakan mahasiswa S-3 Universitas Yamaguchi, pergi ke Rumah Sakit (RS) Niseki/Red Cross. Kebetulan istri saya sedang hamil 5 bulan dan perlu melakukan check up kehamilan dan kondisi bayi. Kedatangan kami di RS ini bukan yang pertama kalinya. Empat bulan sebelumnya kami berdua melakukan cek kehamilan. Beberapa dokter di rumah sakit ini dapat berbahasa inggris dengan baik sehingga kami memahami penjelasan mereka. Ketika pemeriksaan kita mendapatkan dokter laki-laki dan masih muda, hmmm…. sayangnya beliau tidak terlalu bagus berkomunikasi dalam bahasa Inggris. Kemudian beliau memanggil dokter lain yang mampu berbahasa Inggris. Kali ini dokter wanita, umurnya paruh baya tetapi penampilannya cukup modis dan nyentrik. Apalagi kalau melihat model rambut beliau, jadi teringat dengan Rihana atau Miley Cyrus….hehehehe…. Alhamdulilah dari hasil pengujian USG dan urine, kondisi ibu hamil (bumil) dan janin semuanya bagus dan normal.

Fig 1-9

Setelah pengujian selesai, kami diarahkan untuk mengurus administrasi kesehatan ibu dan anak di kantor urusan asuransi. Hmmmm…. entahlah saya  kurang paham dengan nama formal kantor ini. Satu hal yang pasti kantor ini bertugas untuk memberikan pelayanan jaminan kesehatan bagi bumil dan janin hingga bayi berusia lima tahun (balita). Di kantor ini, kami mendapatkan banyak sekali buku tentang kesehatan bumil dan janin. Semua buku kecuali buku petunjuk kesehatan ibu dan anak ditulis dalam bahasa Jepang. Akan tetapi jangan khawatir, bagi masyarakat asing yang tidak bisa membaca huruf jepang dapat memahami isi buku dari gambar kartun yang disediakan oleh penyusun buku. Benar-benar luar biasa, orang Jepang sungguh detil dalam membuat karya termasuk dalam membantu melakukan edukasi bagi ibu muda atau calon orang tua. Berikut beberapa buku yang kami peroleh dari kantor asuransi kesehatan ibu dan anak:

 1. Buku petunjuk kesehatan ibu dan anak

Buku ini berisi tentang data orang tua, referensi kesehatan bumil, situasi rumah dan pekerjaan bumil, data pribadi berhubungan dengan kehamilan, proses kehamilan, rekaman pemeriksaan, catatan khusus untuk orang tua, catatan dokter gigi mengenai kondisi gigi bumil dan setelah melahirkan anak, catatan persalinan, kondisi ibu setelah melahirkan, perkembangan bayi yang baru dilahirkan, rekaman pemeriksaan, rekaman konfirmasi warna kotoran bayi, perkembangan bayi dari usia 1 bulan sd 6 tahun, kurva pertumbuhan berat dan tinggi badan bayi sd anak, grafik tinggi dan berat badan anak-anak, catatan imunisasi, contoh jadwal imunisasi, catatan kondisi sakit pada masa anak-anak, pemeriksaan gigi, bimbingan perawatan kesehatan dan perawatan pencegahan, kurva perkembangan janin, daftar istilah medis bahasa Jepang dan bahasa Indonesia. Sungguh buku ini sangat membantu kami yang merupakan pasangan muda dan akan memiliki buah hati.

2. Buku rekam pertumbuhan anak

Buku ini menyediakan template untuk foto buah hati kita dari lahir sampai dengan balita lho. Di bawah foto anak terdapat kolom dan garis yang disediakan untuk mendeskripsikan momen yang terdapat di dalam foto tersebut. Buku ini tentunya sangat berarti untuk orang tua yang memiliki hobi selfie dan fotografi bersama sang buah hati.

3. Buku rekam hasil tes kesehatan bayi.

Buku ini mencatat hasil analisis kesehatan bayi dari sejak lahir sampai dengan balita. Jadi kita sebagai orang tua dapat mengetahui rekam kesehatan anak. Dokter juga dapat melihat dan menganalisis perkembangan kesehatan anak.

4.    Buku panduan kesehatan lingkungan untuk bumil dan bayi.

Buku ini berisi tentang komik yang menceritakan kondisi lingkungan yang ideal untuk menunjang kesehatan bumil dan janin. Penjelasan tentang SBS (Shaken Baby Syndrome) dan SIDS (Sudden Infant Death Syndrome).  Selain itu buku ini menyajikan beberapa tips singkat untuk ibu muda dalam merawat bayinya.

5.    Buku panduan kesehatan dan vaksinasi bayi.

Buku ini berisi tentang panduan tentang jenis vaksinasi apa saja yang harus dilakukan untuk anak kita sampai dengan usia 5 tahun. Dalam buku ini terdapat tabel standar vaksinasi berdasarkan usia anak beserta rekam hasil vaksinasinya. Berikut beberapa vaksinasi gratis untuk bayi yang dijamin oleh pemerintah Jepang diantaranya Hib, DPT, IPV, DPT-DT-IPV, DT, BCG, MR-M-R

6.    Buku panduan untuk orang tua dalam merawat bayi dari sejak lahir sampai usia balita.

Dalam buku ini dijelaskan tentang asupan nutrisi yang baik dan tepat untuk bayi hingga balita, cara memandikan bayi, cara mengganti popok atau diaper, cara membersihkan kotoran bayi, cara menyusui, cara mengganti baju bayi.

7.    Buku persiapan menyambut kelahiran bayi.

Dalam buku ini terdapat beberapa gambar yang menjelaskan apa saja yg minimal harus disiapkan sebelum bayi lahir mulai dari pakaian, celana, popok, peralatan tidur, peralatan mandi, baby seat saat dalam mobil. Buku ini juga menjelaskan perlengkapan apa saja yg perlu disiapkan oleh bumil menjelang proses kelahiran bayi.

8.    Buku menu makanan bumil dan buah hati

Buku ini memberikan beberapa contoh dan alternatif menu makanan untuk bumil, bayi dan balita. Di dalamnya juga terdapat nilai kalori dari menu yang disajikan. Bagi pasangan muda yang sama sekali tidak mengetahui informasi ini dapat meniru menu yang terdapat dalam buku saku ini.

9.    Buku perlengkapan dan permainan untuk bayi

Buku ini menjelaskan perlengkapan yang diperlukan untuk bayi  seperti baby seat ketika berada dalam kendaraan bermotor, ranjang tidur khusus bayi, termasuk juga di dalamnya permainan atau games yang sesuai untuk bayi dan balita.

Fig10-15

10. Buku pemeriksaan untuk bumil.

Dalam buku ini terdapat beberapa kupon gratis untuk pemeriksaan kesehatan bumil di rumah sakit yang dipilih oleh bumil. Beberapa analisis kesehatan bumil gratis dan ditanggung oleh pemerintah Jepang diantaranya cek urine, cek darah, cek kesehatan gigi, USG. Buku ini dilengkapi dengan tabel untuk mencatat hasil analisis kesehatan bumil. Hmmm benar-benar sangat membantu sekali.

11. Formulir imunisasi anak.

Di dalam buku ini terdapat banyak sekali kupon gratis untuk pemeriksaan kesehatan bayi mulai dari 0 bulan sampai dengan balita. Buku ini sekaligus mencatat jenis vaksinasi apa saja yang sudah dilakukan. Hmmmmm benar-benar patut ditiru ya. Semoga kelak Indonesia juga dapat menerapkan sistem kupon kesehatan gratis bagi seluruh rakyatnya. 

12. Buku panduan umum untuk bayi, bumil dan busui

Buku ini menjelaskan tentang proses perkembangan janin dari embrio sampai dengan berumur 9 bulan, standar berat bayi, senam bumil, kebutuhan kalori bumil, kesehatan gigi bumil, cara memandikan bayi.  Buku ini juga menjelaskan tentang cara meransang produksi air susu ibu (ASI) dan panduan menyusui.

13. Buku panduan untuk keluarga berencana

Dalam buku ini terdapat penjelasan tentang informasi tahap perkembangan anak, langkah yang harus disiapkan bagi orang tua baru dalam menyambut kehadiran buah hati, kesehatan organ intim, dan jenis metode KB (Keluarga Berencana) beserta keuntungan dan kerugiannya. Beberapa jenis KB diantaranya sistem alami/kalender, penggunaan kondom, IUD, IUS, OC, tubektomi, vasektomi.

14. Buku informasi tempat penitipan anak dan sekolah

Buku ini berisi panduan dan informasi tempat penitipan anak dan sekolah di kota Yamaguchi. Alamat, nomor telepon, fasilitas yang ditawarkan, peta lokasi, akses kendaraan umum juga tersedia dalam buku ini. Benar-benar detil ya.

15. Jadwal pengujian atau check up bumil

Jadwal ini sangat membantu bumil untuk mengingat dan melakukan pemeriksaan secara berkala dan rutin ke RS yang dipilih dari awal kehamilan sampai menjelang persalinan. Dalam kertas ini juga diberikan beberapa alternatif jadwal pemeriksaan sesuai dengan dokter kandungan yang dipilih. Hmmmmm…. sangat rapi dan terjadwal bukan???

Fig16

16. Asesoris untuk bumil dan janin

Asesoris berisi pin untuk bumil yang dapat dilekatkan pada tas sehingga ketika di dalam transportasi umum seperti bus dan kereta listrik, penumpang lain dapat mengetahui dan memberikan prioritas tempat duduk pada bumil. Selain itu berisi sticker yang dapat ditempelkan pada kaca mobil, sehingga pengendara lain dapat lebih hati-hati selama berkendara. Nomor telepon darurat juga disediakan untuk bumil dan calon orang tua apabila terjadi sesuatu yang darurat pada bumil dan janin.

Around the World

Goes to Malaysia and Singapore

Bagi sebagian orang pergi ke luar negeri merupakan hal yang biasa, namun bagi sebagiannya lagi merupakan sesuatu yang luar biasa. Sewaktu saya masih kecil, mimpi saya yaitu pergi ke luar negeri dan mengelilingi dunia. Pada saat itu saya hanya bisa berimajinasi seperti anak-anak pada umumnya. Bagi saya pribadi pergi ke luar negeri merupakan suatu impian yang terwujud. Alhamdulilah keinginan yang lama terpendam itu pelan-pelan terwujud juga. Thanks God…..Finally I did it.

Mimpi itu dimulai ketika saya memulai karir sebagai dosen di Jurusan Teknologi Hasil Pertanian Universitas Brawijaya Malang. Tepatnya tahun 2009 saya menjadi dosen muda. Setahun berikutnya saya mendapatkan kesempatan untuk pergi ke Malaysia dan Singapura. Saat itu saya merasa senang sekali karena bisa mewujudkan salah satu mimpi saya. Anda benar saya terbang ke Malaysia dan Singapura.

singapore1

Singapura (2010)

YASHICA Digital Camera

Merlion Park, Singapore (2010)

YASHICA Digital Camera

Malaysia (2010)

YASHICA Digital Camera

Chocolate boutique, Malaysia (2010)

Sepulang dari Malaysia dan Singapura, saya berkeinginan untuk memulai perjalanan ini. Ya setidaknya memulai perjalanan dari negara tetangga. Semoga mimpi mengelilingi dunia itu terwujud dengan indah. Amin ya Rabb…..

KKN Mapres

LAPORAN KKN MAHASISWA PRESTASI_rev 2

ppt kkn mapres

Materi Penyuluhan

Bimbingan Teknis Pengolahan Produk Hasil Pertanian dan Pengemasannya

Teknologi Pengolahan Hasil Tanaman Pangan_part 1

Teknologi Pengolahan Hasil Tanaman Pangan_part2

 

Rekrutmen asisten praktikum semester ganjil 2013/2014

Assalamualaikum

Adik-adik mahasiswa, pendaftaran asisten praktikum di Jurusan THP dapat dilakukan mulai minggu ini. Form pendaftaran dapat diunduh di website Himalogista atau mengambil hard copy formulir di administrasi Jurusan.

Praktikum semester ganjil 2013/2014 yaitu :

1) Praktikum Mikrobiologi Pangan

2) Praktikum Teknologi Pengolahan Pangan

3) Praktikum Biologi

4) Praktikum Evaluasi Gizi Pangan Lanjut

Wassalamualaikum

Formulir unduh disini OR-ASISTEN

 

 

 

 

Notulen Rapat Praktikum

Notulen Rapat Praktikum Mikrobiologi Dasar PS Biotek

Pengumuman Daftar Asisten Praktikum Semester Genap 2012/2013

Assalamualaikum

Berikut ini daftar asisten praktikum semester genap tahun 2012/2013.

Pengumuman Daftar Asisten Praktikum Genap 2012-2013

Brifing asisten akan diumumkan segera (jadwal menyusul).

Terima kasih dan selamat bergabung dengan dunia asisten dan laboratorium.

Wassalamualaikum

 

Formulir Pendaftaran Asisten

Berikut ini form pendaftaran asisten praktikum tahun 2012/2013

Formulir pendaftaran asisten praktikum Genap 2012-2013_rev

WordPress Themes